融机构环保信贷资金、国家重点建设项目、国有企业排污费、环境支出、国家组织援贷款项目等，各种资金的财政、财务收支的真实、合法、效益性进行监督。但如前所述，现有的其他法律法规没有具体明确审计机构在企业环境管理体系中的地位、权限、工作范围，甚至在一些法律中将审计部门排除在环境监督部门之外。因此，一方面通过完善法律体系，使审计组织在环境监督、管理方面享有特定的审计权限，充分发挥审计的作用。如通过修改我国《宪法》、《审计法》、《环境保护法》、《注册会计师法》、《证券法》、《公司法》等相关法律制度，具体明确政府审计机关在环境审计监督中的地位；增加环境审计内容和具体明确各审计机构在环境管理体系中的地位、职责、权利、工作范围和审计方法。另一方面要制定具有可操作性的环境审计准则体系，建立环境审计的基本理论框架。在环境审计准则体系中，明确环境审计体系的基本模式；环境审计进行财务审计、合规性审计、绩效审计和责任审计的内容和方式；绩效审计和责任审计的评价标准和指标；环境审计报告标准格式等内容，使审计人员在进行环境审计时有法可依，有理可据，提高环境审计工作质量。同时，我国也应当授权环保局与司法部门等相关管制机构的联合出击，提高执法能力；进一步强化审计机关的审计监督权，加大在审计结论和决定中对被审计单位和有关人员的行政处罚权，并强调审计决定的强制执行性。
    3.开展联合审计，提高环境审计质量。由于环境审计对应的层次是“自然环境+社会经济”，处于生态学、环境学、资源学、经济学、社会学等众多学科研究的范围。同时，环境审计也是一项涉及多部门的工作，并且技术标准十分复杂，所以，环境审计需要进行跨学科研究，各部门之间、各课题组之间以及国内外之间需要协调配合，因此必须加强与环境保护主管部门的合作，并以多种方式促进各省、市、自治区审计机关之间环境审计的合作与交流。首先，应在组织形式上建立由审计署、环境保护部、财政部等有关部门参加的统一工作机制，在统一协调部署下，共同制订工作方案及目标，并负责组织试点及实施工作。其次，审计部门应加强与环保部门配合，或聘用环保部门专家、法律专家，充分利用外部专家的专业知识和技能进行工作。第三，审计部门应联合环保部门加强对现有审计人员进行培训或轮训，提高他们的环境业务素质和工作能力，保证环境审计工作的常规性开展。第四，环保部门也应加强与审计部门的协调配合，对从事环境专业的人员进行必要的审计、会计知识培训，提高他们在审计方面的业务水平，以更好地协助做好环境审计工作。第五，开展针对节能减排的环境审计，还必须结合能源审计的成果。为了完成“十一五”规划中节能减排目标，国家发改委于2006年4月7日印发了“关于千家企业节能行动实施方案的通知”，拉开了中国企业大规模开展能源审计的序幕。能源审计是按照国家的能源法规、标准，以规定的程序和方法对用能单位的能源生产、转换和消费进行全面审视和监督，是对用能单位能源管理和节能工作的促进，是审计工作在能源管理方面的表示与延伸。能源审计作为一种宏观统计分析方法，以企业为主要用能单位，分析各种层次的能耗指标和节能效果，对整个企业范围内能源利用情况进行全面考察，进而计算出不同层次的耗能指标，有利于对企业的能源使用情况进行有效的监督和考核。因此企业开展能源审计，才能取得可靠的能耗指标和物耗指标，从而计算出企业万元产值能耗和主要产品单位产量综合能耗及其下降率等节能数据，为进行环境审计中的绩效审计和责任审计提供有力的依据。
    4.拓展环境审计领域。一是结合环保需要，不断扩大污染治理措施和专项（专题）环境审计，主要包括：对重点污染治理项目（即环境建设项目）进行专项环境审计；根据治污重点确定审计重点，组织专项环境审计；对重点环保企事业单位进行专项环境审计。二是以财务审计作为环境审计的突破口，着重发展环境绩效审计。通过对企业财务收支情况的审计，计算各年度企业的费用指标、吨产品耗能指标、收入成本指标、利润变化指标，分析企业节能减排资金投入产出情况和使用效果；通过对企业效益的分析，查找影响企业效益的原因，分析能源耗费对效益指标的影响程度，查看是否由于决策失误、管理不善、生产工艺等原因造成能源耗费过高问题，并有针对性地提出有关建议，促进企业向节能减排的发展方式转变。三是结合经济责任审计考评领导人环保责任履行情况。审计机关在开展经济责任审计中应把环保责任履行情况当作重点检查内容之一，坚持经济效益、社会效益、环境效益相统一的原则，认真审查领导者在任职期间环保责任目标落实情况。目前节能减排指标完成情况已经纳入到经济责任审计评价中，通过分析节能减排指标的构成因素、影响指标的原因和影响指标的环节，对经济责任人履行节能减排指标完成情况进行核实，通过经济责任审计促使主要经营者贯彻落实节能减排工作。
    5.全面理解和正确借鉴西方国家的先进经验。随着人类活动对环境影响的深度和广度的增强，环境问题已超越国界，形成和发展为国际环境问题，越来越多的环境问题不再是仅靠一国的国力就可以解决的，而需要各国的共同努力，共同应对。因为种种原因，我国环境审计起步较晚，缺乏经验。因此，我国必须积极借鉴发达国家环境审计的先进理论和操作技术。一方面要使环保法律法规与国际接轨；另一方面要逐步建立起环境审计的理论框架，促使环境审计理论早日与审计实务相结合。现阶段，在对环境资金收支的真实合法性进行审计的同时，适当利用一些审计资源对环境资金进行绩效审计，促进环境保护活动的依法进行，防止弄虚作假、欺诈舞弊行为的发生；促进环境资金使用单位在环境保护活动中既满足需要又降低成本，最大限度地发挥财政资金的使用效益          

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