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   实时荧光PCR和RT-PCR方法检测登革病毒的比较研究      ★★★ 【字体: 】  
实时荧光PCR和RT-PCR方法检测登革病毒的比较研究
收集整理:佚名    来源:本站整理  时间:2009-02-06 14:53:53   点击数:[]    

果        2.2  登革病毒Taqman MGB PCR体系检测结果        2.2.1  有效性检验  按1.7方法,分别提取登革病毒1~4标准株RNA,进行反转录的实时PCR,1~4型均观察到荧光信号增强。        2.2.2  特异性分析  登革病毒1~4标准株、乙脑病毒疫苗株、乙脑病毒强毒株经TaqmanMGB体系检测,只有登革病毒1~4标准株观察到荧光信号增加外,乙脑病毒疫苗株、乙脑病毒强毒株均没有荧光增加信号,见图2。这证明了此TaqmanMGB检测体系的特异性。        2.2.3  登革病毒TaqmanMGB PCR检测体系的应用  用Ⅱ型登革病毒作为阳性对照,对10份发病2周内疑似登革病毒感染病人血清,其IgM、 IgG检测为阳性,8份发病10天内疑似乙脑病毒感染病人血清作为对照,其IgM、 IgG检测为阳性。进行TaqmanMGB PCR检测,结果只有5份疑似登革病毒感染病人血清出现荧光信号增加,其他血清标本均无荧光信号。见图3。注:1、2、3、4分别为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ登        革病毒标准株                   图2  登革病毒荧光PCR特异性分析        注:1:Ⅱ型登革病毒标准株;        2~6:疑似登革病毒感染病人血清标本                图3  血清标本荧光PCR检测结果        3  讨论        Taqman探针是一条与病原体核酸特异性结合的荧光素标记探针,它的结合位点位于普通PCR的2条引物之间[5]。探针的5′端和3′端分别标记报告荧光基团和淬灭荧光基团,PCR扩增在加入一对引物的同时加入荧光探针,探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收。PCR扩增时, Taq酶发挥它的5′→3′的外切酶功能,将探针切成单核苷酸,5′端发出的荧光信号不再被3′端所吸收而能被仪器检测到。每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。因此,随着PCR产物的不断增加,仪器所检测到的荧光信号越来越强。当标本中不含病原体时,PCR反应不发生,不产生荧光信号,其扩增曲线为一水平线。        TaqmanMGB探针是在Taqman原理基础上提出的[6]。TaqmanMGB探针的突出优点是实验优化、步骤简单,提高了配对与非配对模板间的Tm值差异,由于在探针的3′端的淬灭基团为不发光的荧光基团,并且与报告基团在空间位置更接近,使杂交的稳定性和重复性大大提高,实验的结果更精确,分辨率更高。        笔者在TaqmanMGB技术基础上,建立了实时PCR检测1~4型登革病毒的方法。上述研究结果表明:(1)本检测方法可靠性好、敏感性高,比普通PCR方法灵敏度提高30%,可检测发病10天内的临床血清标本,而传统的登革病毒分离方法要求发病5天内的标本,才有可能分离出阳性。(2)特异性强,收集荧光在较高的退火温度(60℃)进行,排除了模板的非特异性扩增,同时,与容易造成血清学交叉反应的乙脑病毒及其临床标本都无交叉反应,可用于登革病毒特异性的实时PCR检测。(3)操作简单,结果观察直观明了,采用闭管检测和荧光技术,避免了普通PCR方法容易产生交叉污染而发生非特异性扩增的缺陷,并可防止病毒扩散及环境污染,以及强致癌物溴乙锭对操作人员的危害。(4)快速。传统的登革病毒分离方法耗时较长,至少需半个月,而本方法所需时间仅4h,比传统方法大为缩短,适用于登革病毒的快速准确的检测。【参考文献】    1  肖维威,马文丽,郑文岭.登革病毒的基因组结构及其基因检测.中华检验医学杂志,2003,26(3):188-189.        2  Jelinek T. Dengue fever in international travelers. Clin Infec Dis,2000,31:144-147.        3  Schwartz E, Mileguir F, Grossman Z,et al. Evaluation of ELISA-based sero-diagnosis of dengue fever in travelers. J Clin Virol,2000,19(3):169-173.        4  Drosten C, Gottig S, Schilling S, et al. Rapid detection and quantification of RNA of ebola and marburg viruses, lassa virus, crimean-congo hemorrhagic fever virus, rift valley fever virus, dengue virus, and yellow fever virus by real-time reverse transcription-PCR. J Clin Microbiol,2002,40(7): 2323-2330.        5  Callahan JD, Wu SJ, Dion-Schultz A, et al. Development and evaluation of serotype-and group-specific fluorogenic reverse transcriptase PCR (TaqMan) assays for dengue virus. J Clin Microbiol,2001,39(11): 4119-4124.        6  Zhao JR, Bai YJ, Zhang QH, et al. Detection of hepatitis B virus DNA by real-time PCR using TaqMan-MGB probe technology. World J Gastroenterol,2005, 11(4):508-510.

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