BV DNA与载体构成了闭环超螺旋结构，而且，一级结构单一，这与体内存在的HBV基因结构差异很大。后者呈部分双链，在血清中尚有裂解片段及复制中间体等形式。因此，无论是在分子杂交，还是在PCR过程中，质粒HBV DNA结构与人体内感染的HBV DNA结构在杂交效率或扩增效率上必然有细微差别，结果将影响定量分析的准确性。如从高水平HBV阳性病人血清大量抽提，或从转基动物血液中纯化得到HBV DNA，可能是一个制备标准品的途径。总之，国际化的标准参照，是保证HBV DNA定量技术精确性和可靠性的前提。
二、分子杂交定量技术和PCR定量技术应当共存下去吗? 以下两点值得考虑:首先，有必要弄清体内HBV复制水平极低者(如低于1fg/ml)占HBV感染人数的比例有多大？这类低水平复制者预后如何?如果这类人群属于急性感染恢复期，或有自然清除病毒倾向者，那么似无必要作常规PCR定量分析，定期进行PCR定性检测即可。其次，有必要建立一种敏感度介于分子杂交和PCR定量技术之间的检测系统。最近有人利用电化学技术观察到DNA双链互补杂交，甚至单个碱基对结合时发生了微电反应，这给我们以很大启示，今后如有可能在这方面打开突破口，那么基因定量分析两大技术共存的局面会发生转变。但是，在目前这两大技术仍有很强的互补性。
三、HBV突变株定量分析意义的研究。HBV基因突变[15]，尤其是前核基因突变，直接影响HBV感染病情转归及抗毒治疗效果，同时也反映了来自体内或外界选择压力的作用。因此，突变株在体内产生的确切原因，突变株与野生株混合存在的发展趋向，突变株是否为耐药株，突变株与野生株相对含量的变化与致病性的关系，突变株与免疫耐受的关系等均是有必要进一步澄清的问题。
四、基因定量技术在HBV感染流行病学方面的应用[16]。HBV经血液传播致病已十分明确，但是体液传播的问题还必须有充足的证据来补充。体液及其它分泌液或排泄物传播HBV是日常生活密切接后感染HBV的直接原因，但其中必然存在“含量与传染性”的关系，那么这个致病的量值完全可以通过HBV感染流行病学研究得到确证。另外，被污染血制品中HBV基因含量与使用血制品后感染HBV的危险性之间的关系也值得研究。
五、加强HBV低水平复制者预后研究。目前看来，所谓健康携带者或无症状带病毒者、干扰素治疗部分反应者(partial responders),以及其他种种HBV在体内呈低复制状态者，在病情、机体免疫状态、预后等方面可能都有一些特殊性，这类病人是否有自然清除病毒的倾向，是否应当实施抗病毒治疗，是否成为重要的传染源等问题都应该作出符合实际的回答。
六、HBV复制水平与抗病毒药物疗效之间的关系研究有待深入。笔者认为，HBV DNA水平与干扰素治疗效果之间的所谓联系在理论上缺乏根据，可能是一种表面现象，有必要探讨其本质。病毒复制水平高低取决于病毒自身的生物活性和机体的免疫功能，应当从病毒和机体两方面寻找突破口，提高干扰素抗HBV的效果。
  最后，在中国，有世界上为数最众的HBV感染及相关慢性肝病患者，但我们在HBV感染诊治研究方面仍处于落后状态。就HBV定量技术而言，目前尚未建立分子杂交定量分析技术，现已报告的PCR定量分析法也属于低水平重复，今后有必要重视这方面的投资和开发。在临床研究领域应当有自己的立足点，不应简单重复国外研究结果。就HBV DNA定量分析意义的研究而言，简单重复的现象已不鲜见，必须引以为戒。                              
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